RIDERKABUTO是幪面超人誕生35周年紀念作品，采用昔日昆蟲(巨型甲蟲角日語KABUTOMUSHI)的設計，配合如幪面超人555般充滿金屬機械感，當中新穎的戰斗場面采用了有如Matrix的拍攝手法，大量CG增加了速度感及觀感，KABUTO的技能及必殺，更顯其更瀟酒有策馳影院。故事講述涉谷被掉下的宇宙碩石毀滅，七年后出現的宇宙生物WORM四處殺害人類，縱使日本特別組織ZECT出動也徒然，成員加賀美新知道只有開發的腰帶能與宇宙生物匹敵，但給擁有靜頭腦且身手敏捷的天道總司，取得甲蟲形態KABUTOZECTOR的控制權變身幪面超人KABUTO把WORM打敗。隨著七年前與巖石掉下毀滅涉谷的宇宙生物WORM，基本形態為綠色的「蛹」，統一的外貌有一雙手掩蓋面孔，遇見過的人類便能模擬對方面貌、行為及聲音，在人類社會殺害及侵略活動，縱使ZECT軍事武器也未能使WORM損傷。從「蛹」進化脫皮為成蟲，而外貌變化各有不同，活動及破壞能力也大大提升，并可進行超越人類感知能力的加速運動性，此現象被稱為「CLOCKUP」。

80s電影一萬年前,52張卡封印著不死的生命體,直到20世紀,這些封印被破解,使這些不死生命再次蘇醒.為了阻止它們在人類的世界進行殺戮,并把他們再次封印於卡內,被稱之為BOARD人類基盤史研究所的鳥丸開發變身腰帶.而橘朔也和劍崎真一被委托成為假面騎士Garren和假面騎士Blade而展開他們的英雄之戰.故事中的初期橘雖然有協助對抗不死生命體,但他亦對劍等人采取對抗態度,但到了故事的中段便恢復正常．故事中還有第三位由相川始變身的假面騎士，命名為卡利斯,他的正體是Undead－Joker，這亦正亦邪的角色令故事更增添豐富，最後出現的假面騎士是由睦月變身的假面騎士Leangle，一開始被梅花Ａ控制，後得劍和橘等人的幫助，最後亦恢復意志，成為正義的戰士．

1999年，墜落地球的巨大隕石奪去了整個海80s電影。與此同時，地球外生物WORM亦開始在世界各地繁殖。為了對抗在一瞬間支配了廣泛地區的WORM，人類成立了對WORM組織ZECT。ZECT開發出幪面超人系統，投入戰場與WORM展開激戰，時間就在這場戰爭中渡過了七年。2006年，在這個沙漠化的地球上，部分ZECT的成員因為不滿組織的束縛而結成獨立團體NEOZECT，而ZECT亦開始對這群背叛者進行肅清。就在這時，天道總司，即是假面騎士KABUTO的出現，令戰局產生極大變化。ZECT總部得到一顆巨型冰塊彗星正在接近地球，於是提出「天空之梯子計劃」，於大氣層的太空站設置巨型CLOCKUP機器，製造轉移空間把彗星拉往地球，製造出莫大的水源。透過這個計劃，ZECT的權力就會越趨龐大，足以支配地球。ZECT利用連接地球和宇宙的軌道電梯發動「天空之梯子計劃」，而從天道手上得知這項情報的NEOZECT，亦決定搶奪這個計劃，壓抑ZECT繼續增大權力。為了組織而戰的ZECT戰士大和鐵騎與矢車想；為了自由而戰的NEOZECT戰士織田秀成和風間大介；為了最愛的日和而戰的加賀美新，還有目的完全不明的天道總司；以及身份神秘的黃金假面騎士。在各人思想交錯的漩渦中，假面騎士的戰鬥已延伸到浩瀚宇宙…